Biospesimen & Biobank
Biobank TMC established in 2005 under the implementation of The Malaysian Cohort (TMC) project. It has successfully collected comprehensive health data and biospecimen samples (blood and urine) stored in Biobank for basic testing and research purposes. Basic blood tests performed include blood sugar levels, fat profiles (cholesterol, LDL, HDL, etc.), and kidney profile. Data and biospecimens will be valuable sources of health and medical research for researchers in the future. Nowadays, Biobank TMC has 38 Frozen Refrigerators (temperature -80oC) and 35 Liquid Nitrogen Tank (temperature -196oC) as a storage medium for over 9 million biospecimen samples such as blood (RBC, MNC, Plasma, Serum, DNA), Urine (Whole urine, Pellet urine) and feces. Biobank TMC consists of three spaces are Main Biobank, Level G at UMBI building (5,000 sq ft), Biobank Satellite 1 satellite at UKM-MTDC, Bangi (2,000 sq ft) and Biobank satellite 2 at HCTM Basement (2,106 sq ft). In 2007-2014, Biobank TMC received a visit from the delegation of Asia Cohort Consortium, Korea, Singapore, Taiwan Biobank to see the implementation of biological sample collection and data as a reference and refinement of work processes. Apart from representing Malaysia in the Asia Cohort Consortium, Prof Datuk Dr. A Rahman A Jamal, Project Head of TMC, and UMBI Research Chief has appointed to the International Cohorts Summit panel and Welcome Trust Longitudinal Populations Studies Committee in recognition of Biobank TMC.
Video:
PROCESSING LABORATORY
No
|
Equipment
|
Quantity
|
Uses
|
---|---|---|---|
1
|
Portable Refrigerator 4°C |
4 unit |
Use as a sample transportation from on-site to the centre
|
2
|
Portable Freezer -20°C | 4 unit |
Use as sample transportation processed from on-site to the centre
|
3
|
Chiller 4°C | 2 unit |
Reagent storage equipment
|
4
|
Freezer -20°C | 14 unit |
As a serum storage from analytical laboratory (after run the biochemical test) and used for reagent storage
|
5
|
Centrifuge machine | 5 unit |
Separate blood and urine samples to collect serum, plasma and urine pellet, etc
|
6
|
NUNC Bioscan 96 Scanner | 8 unit |
As function in data generation of participant sample through scanning procedure
|
7 | Freezer -80°C | 47 unit | Sample Storage |
8 | MVE Vario Freezer | 1 unit | Sample Storage |
9 | Benchtop Centrifuge | 12 units |
Separate blood and urine samples to collect serum, plasma and urine pellet, etc at recruitment area
|
10 | Liquid Nitrogen Tank | 25 units | Sample Storage |
LABORATORY STORAGE DNA
No
|
Equipment
|
Quantity |
Uses
|
---|---|---|---|
1
|
Personal Archive | 4 units |
These 4 cabinets can store up to 100,000 participants’ sample
|
2
|
GenConnect Software | 1 unit |
As function on inventory DNA sample participant systematically
|
3 | Personal Archive Gentegra | 1 unit | This cabinet can store up to 30,000 samples of dry DNA |
4 | Multiscan Go | 1 unit | Measurement concentration of DNA |
5 | Labconco Concentrator | 1 unit | As function on concentrate the DNA |
6 | King Fisher Duo | 1 unit |
Automated extraction DNA samples
|
LABORATORY ANALYSIS
No
|
Equipment | Quantity |
Uses
|
---|---|---|---|
1
|
Cobas Integra 800 | 1 unit |
In purpose of Biochemical testing (fasting blood glucose, full lipid profile and renal profile testing)
|
2
|
Coulter LH 750 Analyzer | 1 unit |
In purpose of Full Blood Count (haematology) testing
|
3 | Variant II Turbo | 1 unit | In purpose of HbA1C testing |
4 | Cobas E411 | 1 unit | In purpose of Thyroid Function Testing |
Biobank TMC telah ditubuhkan pada tahun 2005 di bawah pelaksanaan projek The Malaysian Cohort (TMC) telah berjaya mengumpulkan data kesihatan komprehesif serta sampel biospesimen (darah dan urin) yang disimpan di dalam Biobank untuk tujuan ujian asas dan penyelidikan. Ujian darah asas yang dilakukan ialah termasuk dengan paras gula dalam darah, profil lemak (kolesterol, LDL, HDL, dll.), dan profil buah pinggang. Data dan biospesimen akan menjadi sumber penyelidikan kesihatan dan perubatan yang bernilai pada para penyelidik pada masa akan datang. Sehingga kini Biobank TMC telah mempunyai 38 Peti Sejuk Beku (bersuhu -80oC) dan 35 Tangki Liquid Nitrogen (bersuhu -196oC) sebagai medium penyimpanan bagi lebih 9 juta sampel biospesimen seperti darah (RBC, MNC, Plasma, Serum, DNA), Urin (Whole urine, Pellet urine) dan najis/tinja. Biobank TMC terdiri dari tiga ruang iaitu Biobank Utama, Aras G, UMBI (5,000 kaki persegi), Satelit Biobank satelit 1 di UKM-MTDC, Bangi (2,000 kaki persegi) dan Biobank satelit 2 di Aras Bawah Tanah HCTM (2,106 kaki persegi). Pada tahun 2007- 2014, Biobank TMC telah menerima lawatan dari deligasi Asia Cohort Consortium, Korea, Singapura, Taiwan Biobank bagi melihat pelaksanaan pengumpulan sampel biologi dan data sebagai rujukan dan pemurnian proses kerja. Selain mewakili Malaysia dalam Asia Cohort Consortium, Prof Datuk Dr. A Rahman A Jamal, Ketua Projek TMC merangkap Ketua Penyelidik UMBI telah dilantik sebagai salah seorang panel International Cohorts Summit dan panel Welcome Trust Longitudinal Populations Studies Committee sebagai pengiktirafan kepada Biobank TMC.
MAKMAL PEMPROSESAN
No
|
Peralatan
|
Kuantiti
|
Kegunaan
|
---|---|---|---|
1
|
Portable Refrigerator 4°C |
4 unit | Digunakan sebagai pengangkutan sampel dari lapang ke pusat |
2
|
Portable Freezer -20°C | 4 unit | Digunakan sebagai pengangkutan sampel yang diproses dari lapang ke pusat |
3
|
Chiller 4°C | 2 unit | Digunakan untuk penyimpanan peralatan reagen |
4
|
Freezer -20°C | 14 unit | Digunakan untuk penyimpan serum dari makmal analitikal (setelah menjalankan ujian biokimia) dan digunakan juga untuk penyimpanan reagen |
5
|
Centrifuge machine | 5 unit | Digunakan untuk memisahkan darah dan sampel urin untuk mengumpulkan serum, plasma dan pellet urin, dll. |
6
|
NUNC Bioscan 96 Scanner | 8 unit | Digunakan untuk menghasilkan data daripada sampel peserta melalui prosedur pengimbasan |
7 | Freezer -80°C | 47 unit | Digunakan untuk penyimpanan sampel |
8 | MVE Vario Freezer | 1 unit | Digunakan untuk penyimpanan sampel |
9 | Benchtop Centrifuge | 12 units | Digunakan untuk memisahkan darah dan sampel urin untuk mengumpulkan serum, plasma dan pellet urin, dll di kawasan rekrutmen |
10 | Liquid Nitrogen Tank | 25 units | Digunakan untuk penyimpanan sampel |
MAKMAL PENYIMPANAN DNA
No
|
Peralatan
|
Kuantiti |
Kegunaan
|
---|---|---|---|
1
|
Personal Archive | 4 units | Digunakan untuk menyimpan sehingga 100,000 sampel peserta |
2
|
GenConnect Software | 1 unit | Digunakan untuk inventori DNA sampel peserta secara sistematik |
3 | Personal Archive Gentegra | 1 unit | Digunakan untuk menyimpan sehingga 30,000 sampel dry DNA |
4 | Multiscan Go | 1 unit | Digunakan untuk mengukur kepekatan DNA |
5 | Labconco Concentrator | 1 unit | Digunakan untuk memekatkan DNA |
6 | King Fisher Duo | 1 unit |
Digunakan untuk pengekstrakan sampel DNA secara automatik
|
MAKMAL ANALISA
No
|
Peralatan
|
Kuantiti |
Kegunaan
|
---|---|---|---|
1
|
Cobas Integra 800 | 1 unit | Digunakan untuk tujuan ujian Biokimia (ujian fasting blood glucose, profil lipid penuh, profil buah pinggang) |
2
|
Coulter LH 750 Analyzer | 1 unit | Digunakan untuk tujuan ujian kiraan darah penuh (hematologi) |
3 | Variant II Turbo | 1 unit | Digunakan untuk tujuan ujian HbA1C |
4 | Cobas E411 | 1 unit | Digunakan untuk tujuan ujian fungsi tiroid |